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http://repositorio.usfq.edu.ec/handle/23000/12559| Tipo de material: | bachelorThesis |
| Título : | Comparación de plataformas de clasificación taxonómica en muestras provenientes de murciélagos |
| Autor : | Tulcanaz Montesdoca, Joselyn Katerine |
| Director de Tesis : | Trueba, Gabriel, director |
| Descriptores : | Genómica - Murciélagos - Tesis y disertaciones académicas.;Composición taxonómica |
| Fecha de publicación : | 2022 |
| Editorial : | Quito |
| Citación : | Tesis (Ingeniera en Biotecnología), Universidad San Francisco de Quito, Colegio de Ciencias Biológicas y Ambientales ; Quito, Ecuador, 2022 |
| Páginas : | 37 h. |
| Acceso: | openAccess Atribución-NoComercial-SinDerivadas 3.0 Ecuador |
| Resumen : | Las técnicas de secuenciación de alto rendimiento pueden producir secuencias de múltiples organismos que se encuentran en una muestra (metagenómica). Estos datos deben ser analizados para la comprensión de la dinámica biológica que se encuentra en un nicho determinado, por ejemplo, la determinación de especies microbianas con capacidad de transmisión zoonótica y que están presentes en murcielagos... |
| Descripción : | High throughput sequencing techniques allow to sequence a complex communities present in a given niche, for example, the determination of zoonotic microbial species in bats. The Oxford Nanopore Technologies reads long sequences. Its interpretation is done through bioinformatics platforms that classify organisms by assigning sequences to a known taxon. However, these platforms have a variable sensitivity due to different sample processing protocols, also differ in the time to obtain results and the accessibility of their use. The Kaiju, Kraken, and BugSeq platforms are fast, sensitive, and easy to use, each with different computer allocation methods... |
| URI : | http://repositorio.usfq.edu.ec/handle/23000/12559 |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Biotecnología |
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