Identificación de genes candidatos de tolerancia a estrés por salinidad en tomate de árbol (solanum betaceum) mediante la técnica de despliegue diferencial de genes

Abstract

La salinidad es uno de los principales tipos de estrés abiótico que causa serios problemas en la agricultura a nivel mundial. El tomate de árbol es un cultivo andino que se encuentra distribuido ampliamente en la Sierra ecuatoriana donde está expuesto a la salinidad de los suelos, tanto por la naturaleza volcánica de los mismos como por problemas de erosión y riego. Por esta razón puede ser un cultivo de interés para la identificación de mecanismos de respuesta a salinidad. Uno de los métodos más sencillos de análisis de expresión génica es el despliegue diferencial. Mediante este procedimiento se generan patrones de bandas que se comparan entre individuos expuestos a tratamientos diferentes, con el fin de aislar bandas diferenciales. Por último, la secuenciación de estas bandas lleva a identificar genes candidatos de respuesta frente al tratamiento aplicado. El presente estudio utilizó la técnica del despliegue diferencial en plantas de tomate de árbol con el fin de evaluar su respuesta a una salinidad de NaCl 100mM en distintos tiempos de exposición. Como resultado, se obtuvieron 171 bandas diferenciales, de las cuáles se aislaron 99 correspondientes a ADNc. Del análisis de estas secuencias se encontró que 42 bandas no presentaron homología con bases de datos. De las 57 restantes se pudo inferir que 19 corresponden a ADNc sin función identificada, 10 a genes ribosomales y 28 a genes que codifican para proteínas. Las proteínas potencialmente identificadas se pudieron clasificar de acuerdo a su función en resistencia a estrés, fotosíntesis, estructura de la pared celular secundaria, metabolismo y regulación de la expresión génica. Muchos de los genes potencialmente identificados han sido previamente reportados en otros estudios de tolerancia a estrés abiótico, por lo que mediante análisis más profundos podrían ser utilizados en programas de mejoramiento relacionados con tolerancia a salinidad en el tomate de árbol.