Caracterización de sitios de reconocimiento molecular vía métodos computacionales de dianas involucradas en mecanismos de defensa de las plantas

Abstract

El mecanismo de defensa de las plantas involucra una serie de rutas hormonales que desencadenan la transcripción de una gran variedad de genes asociados a la respuesta de defensa inducida de la planta. La ruta de señalización del ácido jasmónico es un ejemplo de ello. Significativamente, dicha respuesta protectora se ha estudiado muy ampliamente en Arabidopsis thaliana el cual requiere de una COI1 unida a una proteína F-box; una SKP1 unida a otra F-box y una proteína CUL1 para formar el complejo SCF(COI1) que selectivamente señala proteínas represoras (JAZ1) para su posterior ubiquitinación y degradación bajo el reclutamiento de JA-Ile o ácido jasmónico isoleucina. Por lo tanto, es importante determinar sitios importantes de unión entre proteínas para diseñar análogos que reemplacen o inhiban el efecto del ácido jasmónico en las plantas bajo un precio rentable. Para esto, fue necesario emplear herramientas que abarcan la biología computacional para entender la biología molecular del sistema y determinar regiones importantes que regulen la expresión del ácido jasmónico bajo criterios de conservación, sensibilidad mutacional y predicción de estructuras que no solamente sea viable en Arabidopsis thaliana sino también sea dirigido a otros grupos mediados por JA-Ile.