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Título : Identificación de alelos S asociados con autoincompatibilidad en individuos de capulí (Prunus serotina subsp. capulí) mediante la amplificación del Intrón I del gen de la S-RNasa
Autor : Torres, María de Lourdes (dir)
Gordillo Romero, Milton Andrés
Descriptores / Subjects : Ciencias
CIENCIAS BIOLÓGICAS
Fecha de Publicación : dic-2014
Ciudad: Editorial : Quito, 2014
Cita Sugerida : Tesis (Ingeniería en Procesos Biotecnológicos), Universidad San Francisco de Quito, Colegio de Ciencias Biológicas y Ambientales; Quito, Ecuador, 2014
Resumen / Abstract: La autoincompatibilidad gametofítica es un mecanismo genético encargado de prevenir la autofecundación en varias familias de plantas; su funcionamiento está regulado por el locus S y ha sido identificado en varias especies del género Prunus. El conocimiento de la composición alélica S de individuos y cultivares de especies frutales es esencial para el establecimiento de huertos productivos, mediante la definición de combinaciones entre cultivares compatibles. La identificación y clonación de S-RNasas de especies del género Prunus ha permitido el desarrollo de técnicas moleculares para la caracterización de genotipos S en varias especies silvestres y especies poco estudiadas del género. El presente estudio evaluó 80 individuos de capulí (Prunus serotina subsp. capulí) colectados en 8 provincias de la sierra ecuatoriana utilizando primers degenerados diseñados a partir de regiones conservadas del gen de la S-RNasa de varias especies del género Prunus. Los productos de PCR fueron separados en geles de agarosa y mostraron ser polimórficos en tamaño. Adicionalmente, los amplicones polimórficos encontrados fueron secuenciados. El análisis de las secuencias reportó un total de 11 alelos presentes en la muestra estudiada y además mostró la existencia de similitud con secuencias de distintas especies del género Prunus en el locus analizado. Se podría especular que las secuencias encontradas en P. serotina que presentan un alto porcentaje de identidad con las secuencias reportadas en otras especies del género fueron heredadas a partir de un ancestro común que ya las poseía. Por otro lado, las secuencias con un menor porcentaje de identidad habrían tenido orígenes independientes en las distintas especies. El uso de primers consenso degenerados permitió realizar un screening rápido y eficiente de la muestra estudiada, mediante la asignación de genotipos putativos a los individuos analizados. Los resultados obtenidos en este estudio deben ser complementados con pruebas en el campo para confirmar el comportamiento fenotípico de los individuos de capulí estudiados.
Descripción : The gametophytic self-incompatibility is a genetic mechanism that prevents self-fertilization in several plant families. This mechanism is regulated by the S locus and it has been identified in several species of the genus Prunus. Information about of the S allele composition of individuals and cultivars of fruit species is essential for the establishment of productive orchards, by defining compatible combinations of cultivars. Identification and cloning of S-RNases of Prunus species has allowed the development of molecular techniques for the characterization of S genotypes in several wild species and species poorly studied within the genus. This study evaluated 80 individuals of capulí (Prunus serotina subsp. capulí) collected in 8 provinces of the Ecuadorian highlands using degenerate primers designed from conserved regions of the S-RNase gene of several species of the genus Prunus. The PCR products were separated on agarose gels and shown to be polymorphic in size. Additionally, polymorphic amplicons were sequenced. The sequence analysis reported a total of 11 alleles present in the sample evaluated and also shown the existence of similarity with sequences of Prunus species in the locus analyzed. It could be speculated that the sequences found in P. serotina that have a high percentage of identity with the sequences reported in other species of the genus were inherited from a common ancestor who already possessed them. Furthermore, sequences with lower percent of identity would have had independent origins in the different species. Using degenerate consensus primers allowed a rapid and efficient screening of the sample by assigning putative genotypes to the individuals analyzed. The results obtained in this study should be complemented with field tests to confirm the phenotypic behavior of the capulí individuals analysed.
URI : http://repositorio.usfq.edu.ec/handle/23000/3777
Aparece en las colecciones: Tesis - Ingeniería en Procesos Biotecnológicos

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