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Título : Síntesis de un péptido cíclico y estudios computacionales utilizando el método semienpírico PM6 para interacción con metales
Autor : Zambrano, César (dir)
Astudillo Trujillo, Leonardo Isaías
Descriptores / Subjects : Péptido Cíclico
Método Semiempírico
Metales
Síntesis
Fecha de Publicación : 2015
Ciudad: Editorial : Quito: USFQ, 2015
Cita Sugerida : Tesis (Licenciado en Química), Universidad San Francisco de Quito, Colegio de Ciencias e Ingeniería; Quito, Ecuador, 2015.
Resumen / Abstract: Se ha utilizado la síntesis de péptidos de estado sólido para sintetizar un péptido cíclico conformado por (-D-Phe-L-Lys-D-Ser-L-Lys-D-Ser-) y se ha estudiado de forma teórica la capacidad del mismo para poder interactuar con metales como hierro, zinc, calcio y magnesio utilizando métodos de mecánica molecular con el programa Avogadro®, seguidos de una optimización con el método semiempírico PM6 utilizando el programa Spartan®. Se presentan los resultados para el análisis del péptido, los cuales fueron análisis de masas (MALDI-TOF/TOF y ESI MS) así como análisis de aminoácidos (cromatografía de alto desempeño con un analizador de aminoácidos). También se presenta los análisis computacionales describiendo energías mínimas para los complejos péptido-metal, arrojando resultados de una estabilidad mayor dentro del ciclo del péptido (core); se han analizado los metales sin carga, y los iones metálicos M2+, y en el caso del hierro M3+ también.
Descripción : Solid phase peptide synthesis has been used in order to synthesize a cyclic peptide conformed by (-D-Phe-L-Lys-D-Ser-L-Lys-D-Ser-) amino acids, and its ability to interact with metallic atoms and ions (Fe, Zn, Ca and Mg) was studied theoretically using MM (molecular mechanics) methods with the software Avogadro®, followed by an optimization with the semi empirical PM6 method, using the software Spartan®. The analyses of the peptide were carried with mass analyses (MALDI-TOF/TOF and ESI MS), and also with amino acid analysis (HPLC with amino acid analysis). The theoretical results are also presented describing minimum energies for the peptide-metal interactions, implying that the greatest stability of the complex relays in the core of the system. Uncharged metallic atoms as well as metallic ions of the type M2+ were studied (in the case of iron, the ion Fe3+ has also been studied).
URI : http://repositorio.usfq.edu.ec/handle/23000/4140
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