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Título : Análisis preliminar de diversidad genética de una población de osos andinos (Tremarctos ornatus) identificados en el Corredor Ecológico, al Noroccidente del Distrito Metropolitano de Quito
Autor : Torres, María de Lourdes (dir)
Bruque Gutiérrez, María Gabriela
Descriptores / Subjects : Tremarctos Ornatus
Haplotipos
Diversidad Genética
Diversidad De Nucleótidos
Fecha de Publicación : ago-2016
Ciudad: Editorial : Quito: USFQ, 2016
Cita Sugerida : Tesis (Ingeniera en Procesos Biotecnológicos), Universidad San Francisco de Quito, Colegio de Ciencias Biológicas y Ambientales; Quito, Ecuador, 2016
Resumen / Abstract: El oso andino ha sido clasificado como una especie en estado vulnerable debido a la fragmentación y pérdida de hábitat. En especies en estado vulnerable o en peligro de extinción es necesario realizar estudios de diversidad genética para poder diseñar programas de conservación específicos y especializados para las necesidades de la población de estudio. Actualmente, existe poca información disponible acerca de la diversidad genética de las poblaciones de osos en Ecuador. El objetivo de este estudio fue identificar posibles haplotipos y determinar la diversidad genética de una población de oso andino al noroccidente del Distrito Metropolitano de Quito, por medio del análisis de la región D-loop del mtDNA. Para esto se extrajo ADN de muestras de pelo de 13 individuos obtenidas de forma no invasiva en 8 localidades. Se desarrolló un par de primers específicos para la región Hipervariable II (HVII) del D-loop del ADN mitocondrial. Se encontraron cinco haplotipos, H1 presente en dos individuos, H2 en siete, H3 en dos, H4 en uno y H5 en uno. Se identificaron 10 sitios polimórficos (S), todos fueron sustituciones, 5 transversiones y 5 transiciones. La diversidad de genes (Hd: Diversidad de haplotipos) fue alta = 0.7051 y la diversidad de nucleótidos () baja 0.01224. Estos datos pueden sugerir que la población de osos ha experimentado una expansión después de un cuello de botella reciente. Esto implicaría que ha pasado suficiente tiempo para recuperar la diversidad de haplotipos pero no suficiente tiempo para acumular mutaciones en las secuencias analizadas. La población de osos andinos del Noroccidente de Quito ha sufrido fragmentación de hábitat por la extensa actividad humana, sin embargo la información obtenida en esta investigación indica que la población todavía es capaz de reproducirse aunque tiene una diversidad de nucleótidos baja.
Descripción : The Andean bear (Tremarctos ornatus) has been classified as a vulnerable species due to habitat fragmentation and habitat loss. In endangered species or species in vulnerable state, genetic diversity studies are necessary to design specific and specialized conservation programs to address the needs of the study population. Currently, there is limited information available about the degree of genetic diversity of Ecuadorian bear populations. The aim of this study was to identify possible haplotypes and to determine the genetic diversity of a population of Andean bears established in the Northwestern region of Distrito Metropolitano de Quito, by the analysis of the D-loop region of the mtDNA. For this purpose, DNA was extracted from hair samples of 13 individuals through non-invasive methods in 8 locations. A pair of primers was designed for the Hipervariable region II (HVII) of the D-loop from the mitochondrial DNA. Five haplotypes were found, H1 was present in two individuals, H2 in seven, H3 in two, H4 in one and H5 in one. Ten polymorphic sites (S) were identified, all of them were substitutions, 5 transitions y 5 transversions. Gene diversity (Hd: haplotype diversity) was high 0.7051 and the nucleotide diversity was low 0.01224. These data could suggest that the bear population has experienced an expansion after a recent bottleneck. Indicating that there has been enough time to recover the diversity of haplotypes, but not enough time to accumulate mutations in the analyzed sequences. The population of Andean bears of Northwestern Quito has suffered habitat fragmentation, but the information obtained in this study indicates that the population is still able to reproduce although it has a low nucleotide diversity.
URI : http://repositorio.usfq.edu.ec/handle/23000/5907
Aparece en las colecciones: Tesis - Ingeniería en Procesos Biotecnológicos

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