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Tipo de material: bachelorThesis
Título : Duodenal microbiome characterization in patients with and without Helicobacter pylori infection
Autor : Suárez Jaramillo, Andrés Eduardo
Director de Tesis : Cárdenas, Paúl, director
Descriptores : Helicobacter pylori -- Ecuador -- Tesis y disertaciones académicas
Enfermedades gastrointestinales -- Análisis de casos
Palabras clave : Ciencias
Microbiología
Fecha de publicación : 2019
Editorial : Quito
Citación : Tesis (Magister en Microbiología.) , Universidad San Francisco de Quito , Colegio de Posgrados; Quito, Ecuador, 2019
Páginas : 90 h.
Acceso: openAccess
CC0 1.0 Universal
Resumen : La infección por H. pylori afecta aproximadamente al 44.3% de la población mundial y se asocia con patologías gastrointestinales y extra gastrointestinales. Sin embargo, no todos los pacientes infectados desarrollan enfermedad. Las razones para este fenómeno no están completamente entendidas, pero es posible que dependa de muchos factores como las interacciones con el sistema inmune, factores de virulencia y cambios en el microbioma. No se conocen todos los detalles de cómo H. pylori modifica el microbioma, especialmente el duodenal. Por lo tanto, este estudio tuvo como objetivo estudiar el microbioma de biopsias duodenales en pacientes ecuatorianos con y sin infección por H. pylori. Para esto se hizo secuenciamiento del gen 16s rRNA con Illumina Miseq. Las secuencias obtenidas fueron analizadas con Qiime2 para obtener índices de diversidad, asignación taxonómica y abundancia diferencial de taxones en los grupos con infección y sin infección...
Descripción : H. pylori infection affects approximately 44.3% of the world's population and is associated with gastrointestinal and extra gastrointestinal pathologies. However, not all infected patients develop disease. The reasons for this phenomenon are not completely understood, but it is possible that it depends on many factors such as interactions with the immune system, virulence factors and changes in the microbiome. Not all the details of how H. pylori modifies the microbiome, especially the duodenal, are known. Therefore, this study’s aim is to study the microbiome of duodenal biopsies in Ecuadorian patients with and without H. pylori infection. For this, sequencing of the 16s rRNA gene with Illumina Miseq was done, and sequences obtained were analyzed with Qiime2 to obtain indices of diversity, taxonomic assignment and differential abundance of taxa in groups with infection and without infection...
URI : http://repositorio.usfq.edu.ec/handle/23000/10268
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