Identificación de alelos S asociados con autoincompatibilidad en individuos de capulí (Prunus serotina subsp. capulí) mediante la amplificación del Intrón I del gen de la S-RNasa

Abstract

La autoincompatibilidad gametofítica es un mecanismo genético encargado de prevenir la autofecundación en varias familias de plantas; su funcionamiento está regulado por el locus S y ha sido identificado en varias especies del género Prunus. El conocimiento de la composición alélica S de individuos y cultivares de especies frutales es esencial para el establecimiento de huertos productivos, mediante la definición de combinaciones entre cultivares compatibles. La identificación y clonación de S-RNasas de especies del género Prunus ha permitido el desarrollo de técnicas moleculares para la caracterización de genotipos S en varias especies silvestres y especies poco estudiadas del género. El presente estudio evaluó 80 individuos de capulí (Prunus serotina subsp. capulí) colectados en 8 provincias de la sierra ecuatoriana utilizando primers degenerados diseñados a partir de regiones conservadas del gen de la S-RNasa de varias especies del género Prunus. Los productos de PCR fueron separados en geles de agarosa y mostraron ser polimórficos en tamaño. Adicionalmente, los amplicones polimórficos encontrados fueron secuenciados. El análisis de las secuencias reportó un total de 11 alelos presentes en la muestra estudiada y además mostró la existencia de similitud con secuencias de distintas especies del género Prunus en el locus analizado. Se podría especular que las secuencias encontradas en P. serotina que presentan un alto porcentaje de identidad con las secuencias reportadas en otras especies del género fueron heredadas a partir de un ancestro común que ya las poseía. Por otro lado, las secuencias con un menor porcentaje de identidad habrían tenido orígenes independientes en las distintas especies. El uso de primers consenso degenerados permitió realizar un screening rápido y eficiente de la muestra estudiada, mediante la asignación de genotipos putativos a los individuos analizados. Los resultados obtenidos en este estudio deben ser complementados con pruebas en el campo para confirmar el comportamiento fenotípico de los individuos de capulí estudiados.