Evaluación de la variabilidad genética en cinco especies de mora (Rubus spp) mediante marcadores microsatélites SSR

Abstract

Se presenta los resultados de una estudio sobre la variabilidad genética en 5 especies de mora (Rubus spp.) mediante el uso de marcadores moleculares microsatélites SSR. Se seleccionaron 5 especies de mora debido a sus características fenotípicas y a que en el Ecuador no se han realizado estudios previos que demuestren la variabilidad genética entre las 5 especies seleccionadas en este estudio. Las especies utilizadas para este estudio son, Rubus niveus, Rubus adenotrichos, Rubus nubigenus, Rubus lanciniatus y Rubus glaucus. Se utilizaron dos especies dentro de la familia Roseaceae, con el fin de obtener mejor certeza de los resultados obtenidos. Estas especies fueron Rosa variedad “freedom” (Rosa sp) y frutilla variedad Albión. Para este estudio se evaluaron 8 marcadores microsatélites SSR para Rubus y un marcador control ITS2. Se extrajo el ADN de cada muestra, y por medio del proceso de PCR se amplificaron y se visualizaron los datos obtenidos. En el análisis descriptivo se identificaron un total de 32 loci, 100 alelos y un rango de alelos por locus de 2-6. En el análisis estadístico se obtuvo un rango de heterocigosidad observada (Ho) de 0.2-0.9, un rango de heterocigosidad esperada (He) de 0.37-0.95, y un contenido de información polimórfica (PIC) de 0.19-0.95. Se estableció que los mejores "primers" SSR en el estudio, basándonos en un porcentaje alto de Ho, He y PIC, fueron RhM003, Rubus 105b y Rubus 98d. Con el análisis en gel de agarosa al 1,2% se visualizaron los productos de la PCR, creando una matriz de bandas, en presencia (1) y ausencia (0), con estos resultados se elaboro un dendograma con el programa bioinformático DENDROUPGMA, el cual calcula la distancia genética entre cada una de las muestras. Por medio del dendograma se identificaron 3 clúster, en el primero se encuentra Rubus nubigenus, en el segundo los controles, rosa y frutilla, y en el tercero Rubus niveus, Rubus adenotrichos, Rubus lancinatus y Rubus glaucus. Por medio de los resultados obtenido, se determinó que la especie Rubus nubigenus es la que presenta mayor diversidad genética en comparación con las otras especies dentro del estudio, debido a esto se recomienda utilizar esta especie en proyectos de fitomejoramiento con el objetivo de obtener una variedad mejorada que presente características deseadas.