Este programa es parte del convenio interinstitucional entre la USFQ y Embry-Riddle Aeronautical University (ERAU) de Estados Unidos, la cual goza de más de setenta y cinco años de educación aeronáutica. Se trata de un programa académico riguroso que provee bases sólidas para desempeñarse en la industria aeronáutica, la cual incluye empresas de aviación privadas y públicas, aerolíneas, aviación comercial e inclusive la industria militar y de investigación. Se enfoca en las destrezas esenciales requeridas por la industria actual como matemáticas, computación, diseño aerodinámico, diseño estructural y otros. Durante los tres primeros años el estudiante desarrolla dichas destrezas básicas en el Colegio de Ciencias e Ingeniería, para luego transferirse al programa de Ingeniería Aeroespacial en ERAU donde recibirá instrucción especializada. Este programa ha sido reconocido durante los últimos cinco años como el número uno en los Estados Unidos, según el ranking de universidades.