Escherichia coli pathotypes associated with diarrhea in a Coastal Ecuadorian city

Abstract

La diarrea es la segunda causa de muerte en niños menores de cinco años en todo el mundo y Escherichia coli diarreogénica (DEC) es una de las responsables de esta enfermedad en los países en vías de desarrollo como el Ecuador. El diagnóstico de los patotipos de E. coli y el conocimiento de los perfiles de resistencia a antibióticos son necesarios para controlar la enfermedad. El presente estudio analizó DEC en 223 muestras de heces, recogidas del hospital Delfina Torres de Concha de Esmeraldas de Abril a Septiembre del 2014. El diagnóstico se realizó mediante PCR convencional utilizando cebadores específicos para cada patotipo y 12 antibióticos se utilizaron para determinar el perfil de resistencia clínica con el método de difusión en disco. Se encontró presencia de DEC en 46.84% de los casos de diarrea y el 28,57% en los controles, y una asociación con diarrea (Odds Ratio (OR) = 2.20, 95% IC: 1.22-3.98; P= 0.004). El patotipo más prevalente entre los casos y controles fue E. coli adherente difusa (DAEC), con presencia en 26,12% y el 12,5% respectivamente (OR = 2.47; 95% IC: 1.16-5.40, P= 0.009). Co-infecciones de DEC fueron encontradas en un 6,30% y un 4,46% de los casos y controles respectivamente; esta diferencia no fue estadísticamente significativa (OR = 1.44; 95% IC: 0.37-5.93, P= 0.542). Finalmente, los patotipos exhibieron resistencia clínica a 11 de 12 antibióticos analizados, sulfisoxazol (79,76%), seguidos de ampicilina (76,19%), trimetoprim-sulfametoxazol (73.80%), estreptomicina y tetraciclina (61,90%), cefalotina (48.80%), cloranfenicol (17,85%), amoxicilina-ácido clavulánico (9,52%), gentamicina (8,33%), cefotaxima (7,14%) y ciprofloxacina (5,95%). No se encontró resistencia al imipenem.