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http://repositorio.usfq.edu.ec/handle/23000/15050| Tipo de material: | masterThesis |
| Título : | De Novo genome assembly and annotation of X. darwini : exploring the evolution of venom components and sociality in the Galapagos carpenter bee |
| Autor : | Baquero Méndez, Verónica Yolanda |
| Director de Tesis : | Torres, María de Lourdes, dir. |
| Descriptores : | Genómica - Islas Galápagos - Tesis y disertaciones académicas. |
| Fecha de publicación : | 9-may-2025 |
| Editorial : | Quito |
| Citación : | Tesis (Magíster en Ecología Tropical y Conservación), Universidad San Francisco de Quito, Colegio de Posgrados ; Quito, Ecuador, 2025 |
| Páginas : | 64 h. |
| Acceso: | openAccess Atribución-NoComercial-SinDerivadas 3.0 Ecuador |
| Resumen : | Xylocopa darwini, la única abeja endémica de las islas Galápagos, desempeña un papel ecológico vital como polinizador supergeneralista. A pesar de su importancia, poco se sabe sobre su composición genómica o su comportamiento social. Este estudio presenta el primer ensamblaje genómico y transcriptoma de alta calidad de X. darwini, proporcionando información relevante para comprender su ecología evolutiva. Utilizando datos de secuenciación PacBio long-read y RNA-seq de glándulas venenosas, hemos anotado genes relacionados con el veneno y evaluado sus trayectorias evolutivas. Los análisis comparativos con himenópteros solitarios y eusociales (avispas y abejas) revelaron que varios componentes del veneno (fosfatasa ácida, alérgeno 3 del veneno, carboxilesterasa 6 y serina proteasa) presentan patrones moleculares relacionados con el comportamiento social... |
| Descripción : | Xylocopa darwini, the only endemic bee of the Galapagos Islands, plays a vital ecological role as a super-generalist pollinator. Despite its importance, little is known about its genomic makeup or social behavior. This study presents the first high-quality genome assembly and transcriptome of X. darwini, providing relevant information for understanding its evolutionary ecology. Using PacBio long-read sequencing and RNA-seq data from venom glands, we annotated venom-related genes and assessed their evolutionary trajectories. Comparative analyses with solitary and eusocial Hymenoptera (wasps and bees) revealed that several venom components (acid phosphatase, venom allergen 3, carboxylesterase 6, and serine protease) exhibit molecular patterns linked to social behavior... |
| URI : | http://repositorio.usfq.edu.ec/handle/23000/15050 |
| Aparece en las colecciones: | Tesis - Maestría en Ecología Tropical y Conservación |
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